Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
BPTFQ12830 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
BPTFQ12830 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
BPTFQ12830 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.78
BPTFQ12830 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
BPTFQ12830 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
BPTFQ12830 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
BPTFQ12830 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
BPTFQ12830 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.78
BPTFQ12830 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
BPTFQ12830 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
BPTFQ12830 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
BPTFQ12830 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
BPTFQ12830 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
BPTFQ12830 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
BPTFQ12830 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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BPTFQ12830 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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