Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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PTPRCP08575 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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PTPRCP08575 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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PTPRCP08575 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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PTPRCP08575 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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PTPRCP08575 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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PTPRCP08575 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRCP08575 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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