Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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USP18Q9UMW8 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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USP18Q9UMW8 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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