Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms