Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms