Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms