Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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ECM1Q16610 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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ECM1Q16610 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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ECM1Q16610 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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ECM1Q16610 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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ECM1Q16610 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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ECM1Q16610 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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