Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms