Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SSPNQ14714 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms