Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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TCIRG1Q13488 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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TCIRG1Q13488 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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TCIRG1Q13488 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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TCIRG1Q13488 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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