Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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FOXE3Q13461 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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FOXE3Q13461 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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FOXE3Q13461 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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FOXE3Q13461 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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