Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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SF3B2Q13435 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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SF3B2Q13435 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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SF3B2Q13435 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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SF3B2Q13435 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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SF3B2Q13435 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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SF3B2Q13435 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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