Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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TCOF1Q13428 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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