Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
GRIK2Q13002 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms