Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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HOXD10P28358 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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HOXD10P28358 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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HOXD10P28358 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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HOXD10P28358 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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HOXD10P28358 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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