Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 ZBTB40-202ENST00000375647 8685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 CD180-201ENST00000256447 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 ACTR6-201ENST00000188312 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 TRIM49D1-201ENST00000420869 1651 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 TRIM49D2-202ENST00000623787 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 RORB-202ENST00000396204 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 KNG1-202ENST00000287611 1720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TRHP20396 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 CTAGE3P-201ENST00000454280 2404 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 BTBD3-215ENST00000618918 4486 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 CCNK-201ENST00000389879 3524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 FASTKD2-202ENST00000402774 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC022400.3-201ENST00000399449 3810 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC008655.2-201ENST00000597049 304 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 BRDT-204ENST00000394530 3207 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 GANC-206ENST00000566442 2512 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 ZNF814-201ENST00000435989 3146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 PAX8-AS1-201ENST00000333145 2319 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRHP20396 SYNE1-230ENST00000495090 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 DST-206ENST00000370788 17657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 SLC9A6-213ENST00000637234 4691 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 ANO2-202ENST00000356134 3717 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRHP20396 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms