Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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HOXA2O43364 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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HOXA2O43364 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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HOXA2O43364 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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HOXA2O43364 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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HOXA2O43364 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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HOXA2O43364 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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