Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMOD4Q9NZQ9 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TMOD4Q9NZQ9 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TMOD4Q9NZQ9 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms