Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms