Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ZNF548Q8NEK5 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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