Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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VPS72Q15906 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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