Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms