Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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COL19A1Q14993 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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COL19A1Q14993 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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COL19A1Q14993 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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COL19A1Q14993 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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COL19A1Q14993 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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COL19A1Q14993 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
COL19A1Q14993 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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