Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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PRPF4BQ13523 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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PRPF4BQ13523 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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PRPF4BQ13523 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PRPF4BQ13523 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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