Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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