Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 TRBV5-3-201ENST00000390362 343 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ATP5J2-203ENST00000394186 305 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RPL10P6-201ENST00000457497 318 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC006070.1-201ENST00000508151 193 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC005262.1-201ENST00000588562 362 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC005884.1-201ENST00000588604 429 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AL133351.5-201ENST00000612789 106 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 HAVCR2-201ENST00000307851 2907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 XIRP2-202ENST00000409043 3292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 TRIM53BP-201ENST00000532912 1720 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 DNAJC5G-202ENST00000402462 1904 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 LRRC2-AS1-201ENST00000599511 2291 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AFF1-211ENST00000544085 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 LDB3-201ENST00000263066 3873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 PDE7A-202ENST00000396642 2986 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 U3.1-201ENST00000362500 215 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 LINC02121-201ENST00000507950 432 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC069360.1-202ENST00000533941 557 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC068631.1-229ENST00000599314 739 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AL137190.1-201ENST00000603288 282 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 MAPK10-329ENST00000641555 2656 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AL353052.2-201ENST00000441459 2241 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 CHAF1B-201ENST00000314103 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 TTC23-202ENST00000394129 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 KIAA1217-201ENST00000307544 3281 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 FAM13A-205ENST00000503556 3386 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 GOSR2-238ENST00000640495 3395 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 LINC00598-208ENST00000617777 2551 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
MKRN4PQ13434 CFAP47-201ENST00000297866 3608 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
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