Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCOF1Q13428 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCOF1Q13428 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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