Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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TRAF1Q13077 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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TRAF1Q13077 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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TRAF1Q13077 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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TRAF1Q13077 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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TRAF1Q13077 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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TRAF1Q13077 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAF1Q13077 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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