Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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HOXD10P28358 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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HOXD10P28358 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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HOXD10P28358 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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HOXD10P28358 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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HOXD10P28358 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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