Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPREP23469 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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PTPREP23469 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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PTPREP23469 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPREP23469 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPREP23469 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPREP23469 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPREP23469 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPREP23469 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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