Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRAP18433 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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PTPRAP18433 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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PTPRAP18433 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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PTPRAP18433 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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