Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC233290.2-201ENST00000552852 390 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AL160314.2-202ENST00000553792 534 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC087499.3-201ENST00000578210 717 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC087645.1-201ENST00000588528 291 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 MIR8075-201ENST00000614354 80 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 TM2D2-203ENST00000456845 3295 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC027097.2-201ENST00000588925 1976 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 SEPT4-216ENST00000580844 1396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SNPHO15079 NAA11-201ENST00000286794 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 ZNF577-201ENST00000301399 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC126124.1-201ENST00000426104 185 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC009988.1-201ENST00000434988 310 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RN7SL338P-201ENST00000481467 293 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RN7SL862P-201ENST00000491550 298 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC008799.1-201ENST00000495909 457 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC113208.1-201ENST00000497944 318 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AL031864.2-201ENST00000498507 350 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 TBC1D29-201ENST00000579181 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 TBC1D29-204ENST00000584297 602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 APOC2-202ENST00000585786 880 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 APOC2-204ENST00000591597 447 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC006547.1-208ENST00000598339 805 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 RBM22P6-201ENST00000611682 867 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 CKAP2-203ENST00000378037 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC016747.1-201ENST00000420918 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 ZNF655-213ENST00000425063 4624 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SNPHO15079 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 2191 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 IRAK4-214ENST00000613694 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 AC036108.4-201ENST00000611654 2516 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 CFAP58-202ENST00000369704 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SNPHO15079 LINC00662-203ENST00000586954 2254 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172 ms