Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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RFXAPO00287 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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RFXAPO00287 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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