Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC37.22■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
DCAF1Q9Y4B6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
DCAF1Q9Y4B6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms