Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms