Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHF8Q9UPP1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms