Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms