Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP68Q9UHB9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms