Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms