Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDH10Q9P2E7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms