Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms