Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms