Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms