Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DUOX1Q9NRD9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUOX1Q9NRD9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUOX1Q9NRD9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUOX1Q9NRD9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUOX1Q9NRD9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUOX1Q9NRD9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUOX1Q9NRD9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUOX1Q9NRD9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUOX1Q9NRD9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms