Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHST12Q9NRB3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHST12Q9NRB3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms