Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms