Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRDM12Q9H4Q4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRDM12Q9H4Q4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms