Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM175Q9BSA9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM175Q9BSA9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms