Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms