Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID3AQ99856 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms